Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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