Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN2CQ14957 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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