Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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