Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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