Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIDRQ14159 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms