Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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