Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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