Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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