Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHROOM2Q13796 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms