Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CUL4AQ13619 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CUL4AQ13619 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CUL4AQ13619 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CUL4AQ13619 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CUL4AQ13619 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CUL4AQ13619 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CUL4AQ13619 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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