Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms