Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA5AQ13591 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA5AQ13591 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms