Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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