Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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SP140Q13342 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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SP140Q13342 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP140Q13342 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP140Q13342 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP140Q13342 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP140Q13342 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP140Q13342 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP140Q13342 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP140Q13342 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP140Q13342 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP140Q13342 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP140Q13342 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP140Q13342 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP140Q13342 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP140Q13342 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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