Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR5A1Q13285 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms