Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RLFQ13129 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RLFQ13129 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RLFQ13129 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RLFQ13129 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RLFQ13129 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RLFQ13129 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RLFQ13129 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RLFQ13129 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RLFQ13129 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RLFQ13129 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RLFQ13129 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RLFQ13129 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RLFQ13129 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RLFQ13129 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RLFQ13129 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RLFQ13129 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RLFQ13129 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RLFQ13129 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RLFQ13129 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms