Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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