Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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PTP4A2Q12974 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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