Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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