Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285 ms