Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SREBF2Q12772 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SREBF2Q12772 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SREBF2Q12772 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SREBF2Q12772 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SREBF2Q12772 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SREBF2Q12772 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SREBF2Q12772 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SREBF2Q12772 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SREBF2Q12772 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SREBF2Q12772 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SREBF2Q12772 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
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