Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms