Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms