Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms