Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms