Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms