Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms