Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms