Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSPL2Q05D32 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms