Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms