Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms