Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms