Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIBQ01892 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms