Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms