Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms