Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms