Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX1P83916 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX1P83916 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CBX1P83916 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CBX1P83916 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CBX1P83916 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX1P83916 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms