Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB1P82279 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB1P82279 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB1P82279 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB1P82279 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB1P82279 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB1P82279 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB1P82279 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB1P82279 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRB1P82279 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRB1P82279 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRB1P82279 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRB1P82279 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRB1P82279 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRB1P82279 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CRB1P82279 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRB1P82279 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRB1P82279 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRB1P82279 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRB1P82279 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRB1P82279 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB1P82279 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRB1P82279 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB1P82279 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB1P82279 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB1P82279 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB1P82279 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB1P82279 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB1P82279 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB1P82279 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB1P82279 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB1P82279 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB1P82279 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB1P82279 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB1P82279 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB1P82279 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB1P82279 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB1P82279 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB1P82279 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms