Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX1P78414 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX1P78414 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX1P78414 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX1P78414 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX1P78414 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX1P78414 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms