Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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