Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms