Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms