Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA9P57773 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA9P57773 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA9P57773 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA9P57773 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms