Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms