Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BACE1P56817 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BACE1P56817 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BACE1P56817 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BACE1P56817 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BACE1P56817 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BACE1P56817 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BACE1P56817 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BACE1P56817 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BACE1P56817 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BACE1P56817 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BACE1P56817 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BACE1P56817 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BACE1P56817 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BACE1P56817 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
BACE1P56817 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BACE1P56817 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BACE1P56817 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BACE1P56817 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms