Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms