Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms