Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRAP54198 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRAP54198 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRAP54198 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRAP54198 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRAP54198 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRAP54198 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRAP54198 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRAP54198 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRAP54198 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRAP54198 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRAP54198 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRAP54198 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRAP54198 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRAP54198 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIRAP54198 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIRAP54198 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms