Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2KP53803 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2KP53803 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms