Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms